O Brasil confirmou os dois primeiros casos da subvariante XQ da Covid-19. O sequenciamento genético foi feito pelo Instituto Butantan, em São Paulo, Estado onde foi registrado as infecções. O genoma foi ocasionado com a junção das sublinhagens BA.1.1 e BA.2 da ômicron.

Ao LeiaJá, a Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo confirmou que está mantendo o monitoramento do cenário epidemiológico em todo território estadual e que o balanço da vigilância aponta mais de 10 mil casos da variante ômicron e suas sublinhagens.

"O comportamento de um vírus pode ser diferente em locais distintos em virtude de fatores demográficos e climáticos, por exemplo. A vigilância estadual, por meio do Centro de Informações Estratégicas em Vigilância em Saúde (Cievs), monitora, acompanha e auxilia nas investigações, em tempo real de todas as Variante de Preocupação", destacou a secretaria, em nota. 

A pasta pontua que as medidas já conhecidas pela população seguem cruciais para combater a pandemia do coronavírus, que ainda não acabou.

Um grupo de pesquisadores assegurou nesta sexta-feira (11) ter identificado particularidades genéticas que poderiam explicar porque alguns pacientes sofrem formas mais severas da covid-19, o que poderia, segundo eles, melhorar os tratamentos.

"A beleza da genética é que pode prever os efeitos de um medicamento. O realmente excitante deste estudo é que identificamos genes que estão diretamente implicados do ponto de vista terapêutico, o que pode levar a tratamentos", explicou o principal autor do estudo, publicado na revista Nature, Kenneth Baillie, da Universidade de Edimburgo.

Para tentar determinar porque alguns pacientes sofrem com as formas mais severas da doença, os pesquisadores analisaram o genoma de mais de 2.000 britânicos, muito afetados pela covid-19.

Comparando o genoma com o de outras pessoas, eles encontraram oito sequências genéticas comuns nos doentes graves de covid. Estas sequências desempenharam um papel determinante na resposta inflamatória do organismo para combater agentes patogênicos como o novo coronavírus.

Ao aprofundar este exame, eles conseguiram isolar dois genes em particular - TYK2 e CCR2 -, cujo papel é codificar as proteínas implicadas na resposta inflamatória do organismo.

Teoricamente, agir nestas substâncias poderia diminuir a gravidade da doença.

"Demonstramos que os genes que produzem mais proteína TYK2 representam mais riscos de covid. Agora existe um medicamento no mercado que a inibe", explicou Kenneth Baillie durante coletiva de imprensa on-line.

O grupo de remédios que limita a ação da proteína TYK2, denominados inibidores das Janus quinases (JAK), são usados em particular contra a poliartrite reumatoide, uma doença inflamatória.

Também está sendo testado um tratamento mediante anticorpos de síntese, que combate a ação da proteína CCR2, explicou Baillie.

É urgente testar estes medicamentos em pacientes graves de covid-19, pediram Baillie e seus colegas.

Nos últimos meses, várias pistas genéticas foram exploradas para tentar explicar as formas mais agressivas do novo coronavírus.

A China informou nesta sexta-feira (19) 25 novos casos de Covid-19 em Pequim e publicou o genoma do coronavírus detectado em um recente foco de infecção na cidade, que apresenta semelhanças com uma cepa europeia.

A capital chinesa retornou a uma certa normalidade após dois meses sem contágios. Mas um foco epidêmico na semana passada obrigou as autoridades a impor o confinamento em vários bairros e a organizar de testes de diagnóstico em larga escala.

As autoridades suspeitam que a origem das novas infecções seria o mercado atacadista de Xinfadi, ao sul da cidade. o vírus foi detectado nas tábuas para cortar salmão importado.

O governo da cidade divulgou nesta sexta-feira novas informações sobre o surto epidêmico e revelou informações sobre o genoma do vírus à Organização Mundial da Saúde (OMS) e a cientistas estrangeiros.

"De acordo com os resultados preliminares da epidemiologia genômica, este vírus seria procedente da Europa", declarou Zhang Yong, alto funcionário do Centro de Controle e Prevenção de Doenças da China.

"Mas é diferente (da cepa) do vírus que circula atualmente na Europa. É anterior", completou em um artigo publicado pela comissão nacional anticorrupção.

Ele indicou que pode ser uma versão do vírus que circulou no continente europeu há várias semanas ou meses.

Zhang Yong menciona várias hipóteses: o vírus pode ter vindo da Europa através de alimentos congelados ou poderia estar há bastante tempo no mercado de Xinfadi, onde teria sobrevivido graças à umidade e ao escuro. Daí sua semelhança com cepas mais antigas.

"É possível que o vírus que provoca atualmente uma epidemia em Pequim tenha viajado de Wuhan para a Europa e retornado agora à China", afirmou Ben Cowling, professor no Centro de Saúde Pública da Universidade de Hong Kong.

No total, Pequim registrou 183 casos de Covid-19 devido ao novo foco da doença, de acordo com o balanço oficial.

Em menos de 48 horas após o registro do segundo caso de brasileiro infectado com coronavírus, uma equipe de pesquisadores brasileiros conseguiu novamente sequenciar o genoma do vírus. São os mesmos cientistas que tinham feito o primeiro sequenciamento, num procedimento que deve virar rotina para a epidemia.

E a nova análise mostra que o patógeno do segundo caso é levemente diferente do primeiro. Pela conclusão, o primeiro tinha se assemelhado mais com vírus que haviam sido sequenciados na Alemanha. Já o segundo se aproxima mais de vírus sequenciados na Inglaterra. E ambos são diferentes das sequências chinesas.

Nos dois casos, porém, os pacientes foram contaminados na Itália, mas como cientistas italianos ainda não apresentaram os sequenciamentos dos vírus que estão no país, a comparação não pôde ser feita com o material de lá.

De acordo com a pesquisadora Ester Sabino, do Instituto de Medicina Tropical da USP, que compõe os esforços de sequenciamento junto com pesquisadores do Instituto Adolfo Lutz e da Faculdade de Medicina da USP, essas variações confirmam que a transmissão interna entre os países da Europa já está bem estabelecida.

"A epidemia já está há algum tempo na Europa e já passa de um país a outro. Mas nesse momento ainda não conseguimos saber se ela foi da China para a Alemanha e a Inglaterra e de lá para a Itália ou se foi para a Itália e de lá foi para a Inglaterra", por exemplo.

Ela explica que a cada mês que passa o vírus sofre uma mutação e fica com uma espécie de código da região por onde passou, mostrando o seu caminho.

"Ainda é arriscado inferir muita coisa com apenas dois genomas, mas o que podemos dizer é que os dois casos não tiveram a mesma fonte de contaminação. Isso é importante para os epidemiologistas rastrearem a dinâmica da doença", explica Claudio Sacchi, do Instituto Adolfo Lutz, que coordena os trabalhos.

Ele afirma, no entanto, que os próximos sequenciamentos não devem ser tão rápidos. Para analisar os dois com um tempo tão curto - o primeiro havia sido apresentado na sexta e já no sábado os pesquisadores receberam a segunda amostra - ele conta que os cientistas quase não dormiram.

"Foi importante porque eram os primeiros e a gente mostrou que temos capacidade, mas a partir de agora o trabalho deve ser mais sereno. Até porque não precisa ser tão rápido assim. Aqui nós analisamos sarampo também, que teve a primeira morte do ano em São Paulo", explica.

O trabalho faz parte do projeto Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (Cadde), apoiado pela Fapesp e pelo Medical Research Centers, do Reino Unido, que desenvolve novas técnicas para monitorar epidemias em tempo real e oferecer pistas para responder o problema.

Pesquisadores conseguiram decodificar quase todo o genoma da quinoa, um avanço que deve facilitar o desenvolvimento da cultura deste "grão de ouro", que é visto como uma esperança para alimentar a humanidade, segundo um estudo publicado nesta quarta-feira (8) na revista científica Nature.

O genoma desta planta (Chenopodium quinoa), cultivada pelos incas nos Andes séculos atrás, tem mais de 1,5 bilhão de blocos de DNA.

"A quinoa poderia fornecer uma fonte de alimento saudável ​​e rica em nutrientes" nas regiões áridas e secas do mundo, disse Mark Tester, professor na Universidade King Abdullah de Ciência e Tecnologia, na Arábia Saudita, que liderou a equipe internacional de pesquisadores.

"O conhecimento do seu genoma nos faz dar mais um passo nessa direção", acrescenta.

A quinoa apresenta uma série de benefícios nutricionais. Muitas vezes considerada um cereal, ela pertence, na verdade, à família da beterraba e do espinafre (Chenopodiaceae), e é pobre em gorduras e rica em ferro, ômega-3 e proteínas.

De acordo com especialistas, a quinoa é o único alimento vegetal que tem todos os aminoácidos essenciais; o seu valor nutricional é maior do que o do ovo ou o do leite.

"A quinoa é incrivelmente resistente e pode crescer em solos pobres, salinos e em altas altitudes", observou Tester.

Por outro lado, este vegetal produz naturalmente uma substância amarga, a saponina, de modo que os grãos devem ser lavados abundantemente antes do consumo.

Os pesquisadores identificaram um gene que parece regular a produção de saponina na quinoa.

"Isto poderia facilitar a seleção de plantas sem saponina para dar aos grãos um gosto mais doce", disse Tester.

O Peru e a Bolívia são os principais produtores de quinoa. Nos últimos anos, o grão virou moda entre os fãs de alimentos saudáveis dos países ocidentais.

O Google firmou uma parceria com cientistas que permitirá aos pesquisadores usarem plataformas informáticas do gigante da internet para acelerar sua investigação biomédica sobre o genoma. O gigante californiano colaborará com o Broad institute of Biomedical and Genomic Research, um projeto conjunto da Universidade de Harvard e do prestigioso Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT).

"A informação genômica em grande escala acelera o progresso (em luta) contra o câncer, a diabetes, os transtornos psiquiátricos e muitas outras doenças", afirmou Eric Lander, diretor do Instituto Broad, por ocasião do anúncio deste acordo nesta quarta-feira (24).

"Salvar, analisar e gerenciar esses dados tornou-se um desafio crucial para os investigadores em biomedicina. Estamos muito animados para trabalhar com esses engenheiros talentosos e experientes do Google para desenvolver maneiras de fortalecer a pesquisa ao redor do mundo, oferecendo acesso e uso de informações" sobre o genoma, explicou.

Num primeiro momento, a ferramenta de análise do genoma (Genome analysis toolkit) do centro de investigação estará disponível na nuvem do Google. O objetivo é "permitir que qualquer pesquisador de genética possa colocar online, salvar e analisar dados", revelou um comunicado conjunto da Google e do centro.

Em seu blog oficial, o Google explicou que ambas entidades "trabalharão juntas para (...) construir novas ferramentas e desenvolver novos conhecimentos para impulsionar a pesquisa biomédica utilizando uma ampla experiência em bioinformática, uma ferramenta de análise de grande alcance, e uma ampla infra-estrutura informática". O grupo já havia criado, há dois anos, sua própria base de dados em matéria de genômica.

Um grupo internacional de cientistas sequenciou o genoma de 45 espécies de aves, em um esforço sem precedentes para redesenhar a "árvore da vida" dos pássaros.

O projeto, que envolveu centenas de pesquisadores de 20 países ao longo de quatro anos, teve os resultados divulgados nesta quinta-feira, 11, em 29 artigos científicos publicados simultaneamente, oito deles em uma edição especial da revista Science.

Supercomputadores foram usados para analisar a enorme quantidade de dados. Os resultados revelaram como vários ramos da família das aves divergiram em diferentes espécies, o que deverá ajudar a responder antigas questões sobre a evolução a partir dos dinossauros.

Segundo um dos cientistas que participaram do projeto, o brasileiro Claudio Mello, da Universidade de Ciência e Saúde do Oregon (Estados Unidos), pela primeira vez, dezenas de espécies foram sequenciadas dentro de um mesmo grupo de vertebrados. Ele afirma que a quantidade de dados obtidos permitiu traçar a árvore da vida (ou árvore filogenética) com confiabilidade inédita.

"As aves são um dos grupos mais diversos que existem, com cerca de 10 mil espécies. Essa diversidade tornava complexa a tarefa de entender as relações entre elas e, por isso, até hoje não tínhamos uma árvore filogenética confiável."

De acordo com Mello, ao acessar os dados genômicos completos de pelo menos uma ave das principais linhagens, foi possível reorganizar a árvore e compreender o parentesco entre as espécies. "A árvore da vida era baseada na similaridade de traços observados nas espécies, agrupando aves de rapina, aves aquáticas e assim por diante. Com os dados, conseguimos ver que várias classificações estavam erradas."

O estudo fortalece a teoria do "big-bang" da evolução das aves, que se diversificaram em muitas espécies em período considerado curto, entre 10 e 15 milhões de anos, após a extinção dos dinossauros, há cerca de 70 milhões de anos. "Muitos ramos surgiram quase simultaneamente. Isso aumentava a dificuldade para organizar a árvore evolutiva das aves. Agora, temos dados confiáveis que deverão gerar muitas descobertas nos próximos anos." As informações são do jornal O Estado de S. Paulo.

Um grupo de cientistas chilenos, noruegueses e canadenses decodificou o genoma completo do salmão do Atlântico, o que permitirá fazer avanços na produção aquícola deste pescado, anunciou a parte chilena da equipe de pesquisadores.

Com um custo total de US$ 10 milhões, dos quais o Chile aportou um quarto, o avanço científico permitirá melhorar a produção do peixe, torná-lo mais resistente a doenças e melhorar a suscetibilidade no processo de produção aquícola através da seleção genômica.

"Esta descoberta nos permite fazer uma melhoria genética com maior eficiência. Melhora-se bastante, uns 30% mais rápido, com seleção genômica do que sem ela, e isto não se pode fazer sem o genoma", afirmou Roberto Neira, engenheiro agrônomo da Universidade do Chile, encarregado do projeto.

Até agora, segundo o cientista, tinha sido decodificado o genoma do peixe-zebra, de tamanho pequeno, e a tilápia está em processo, embora não tenha sido finalizado ainda. O genoma do salmão atlântico é um dos mais complexos, pois se trata de uma espécie poliploide, onde há vários jogos de cromossomos envolvidos.

O projeto, que constitui o sequenciamento do genoma do primeiro dos peixes grandes, foi uma iniciativa da Cooperação Internacional para Sequenciar o Genoma do Salmão Atlântico (ICSASG, na sigla em inglês) e nele colaboraram durante cinco anos cientistas de Chile, Noruega e Canadá.

Decifrar o genoma das chaves para "conseguir que o salmão cresça mais rápido, que o uso de alimentação seja menor por quilo de peso que ganha, o que diminui o custo de alimentar", explicou à imprensa Eduardo Bitran, vice-presidente da estatal Corporação de Fomento da Produção (Corfo).

Também ajuda a elucidar "como tentar identificar certas características que os tornam mais resistentes a doenças, o problemas que tivemos nos últimos anos", acrescentou. Em 2009, o vírus ISA (anemia infecciosa do salmão, que não é transmissível aos humanos) afetou duramente a indústria do salmão atlântico no Chile e obrigou a antecipar capturas e eliminar milhares de peixes infectados.

A salmonicultura é, ao lado do cobre e da celulose, uma das estrelas da cesta de exportação chilena. Segundo dados da organização Salmón Chile, as exportações nacionais do pescado superaram em 2013 os US$ 3,5 bilhões. Anualmente se produziram 400.000 toneladas de salmão Atlântico, 60% do volume da indústria de salmonídeos. Os resultados do projeto estão disponíveis no site de acesso livre www.corfo.cl/genomasalmon.

O Centro de Informática (CIn) e o Departamento de Genética da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) organizam dois eventos: o X-Meeting e o Brazilian Symposium of Bioinformatics 2013 (BSB 2013). Os encontros serão realizados entre os dias 3 e 6 de novembro, no Mar Hotel, Recife.

O objetivo da iniciativa é promover debates sobre tecnologia e genética. O evento trará palestras com pesquisadores renomados nas áreas de genética e tecnologia:

Robert Gentleman (criador do pacote estatístico R),

Andrew Simpson (coordenador do 1º Projeto Genoma Brasil), 

Andrej Sali (criador do aplicativo Modeller), 

Julie Mitchell (Diretora do Bacter Institute da UW-Madison), 

Peter Stadler (Austrian Academy of Sciences), 

David Roos (American Academy of Microbiology),

Martin Tompa (diretor do Programa Interdisciplinar em Biologia Molecular da Universidade de Washington).

X -meeting é um evento anual organizado pela Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C) , filiado à Sociedade Internacional para Biologia Computacional (ISCB) , e tem como principal objetivo proporcionar discussões de cientistas brasileiros e internacionais sobre avanços recentes e questões referentes ao assunto.

As inscrições estão abertas no site http://bsb2013.cin.ufpe.br/